当原发性肝癌伴有腹水、黄疸、远处搬运等状况时，称为晚期原发性肝癌。晚期原发性肝癌的医治较艰难，临床医治作用不抱负，现多选用中西医结合的医治办法。

对原发性肝癌伴腹水者，可先予中药或西药利尿剂医治，腹水衰退后，依据肝内肿瘤状况，医生在线答疑，仍可按上法医治。如为血性腹水，则不易衰退；门静脉或肝静脉有癌栓者，予中西药利尿剂不易收效。如原发性肝癌结节决裂出血，应予止血处置，一起选用腹部加压包扎。

原发性肝癌伴黄疽者，如系肝门区肿块压榨所造成的阻塞性黄疽，可选用部分放射医治，或部分瘤内注射、或介入医治，或内支架或外引流；如系非黄疸，可予中医药医治、保肝医治。

对原发性肝癌有肺搬运者，如肝癌原发灶已操控，好医师网，只要单个肺搬运灶，可思考切除，或部分放射医治。如系多个搬运灶，或充满两肺者，可思考放射医治（全肺野照耀），或化学医治、生物医治。如肝癌原发灶未医治，或医治未见操控，搬运灶为单个，或较为限制，亦可思考放疗。

如全肺充满搬运者，则可选用生物医治或化学医治、中医药医治。

晚期原发性肝癌骨搬运，如搬运灶为单个或几个，可选用放射医治。如骨搬运广泛，可予化疗药物、生物医治或放射性核素医治，亦可予骨膦、阿可达等医治。

对门静脉、肝静脉、下腔静脉有癌栓者，可试用肝动脉灌注化疗，通常不选用肝动脉栓塞，可用生物医治或中医药医治。