科学网EGFR,肺癌,冠醚,化学键,和新药研发好医师网
昨天晚上睡觉前,看到美国食品药品管理局(FDA)的一封电子邮件,说的是他们批准了一个治疗肺癌的新药。【1】 这是个针对EGFR(表皮生长因子受体)【2】的小分子药物。非常有趣是,这个药物分子与众不同,因为它是通过和EGFR形成了一个化学键。这是后话,暂且不提。
肺癌,在中国已经是个非常严重的问题。抽烟,烧煤,汽车尾气,工业废气,大火做饭,等等原因给国人的肺部造成了严重的损伤。目前,肺癌是所有肿瘤中发病率、死亡率最高的肿瘤,我国每年新发肺癌患者70万人,其中三分之二的患者初诊时已失去手术机会。【3】
因此,找到肺癌的有效治疗意义非凡。去年,一个民办企业,浙江贝达公司在国内申报的治疗肺癌药物被批准,一时间成为重大新闻,在网络和民间广为流传。【4】
作为一个每天忙着在原子和原子团之间涂鸦着不同化学键的化学师【9】,对这些事件不可能无动于衷。因此在昨天半夜了也赶紧发了一个简报。【5】醒来之后就得花点时间来把这些个分子理顺关系,完成昨天自己布置的家庭作业。至少,也得像竞选美女的程序一样,让她们把外套统统脱掉,看看三点的具体参数。当然,那是开玩笑。下面就简单地把这些相关的分子结构和相关的非化学师没有学过的知识罗列一下。1张好的图片胜过了1000个字,而且我的码字能力有限,所以就看图说话吧。先写这些,有问题的童鞋欢迎举手。
图1:特罗凯(Tarceva,【6】)分子是EGFR抑制剂。它的大部分原子深深地插入蛋白的活性中心(ATP结合的点),而2条尾巴在周边随意起舞(这里是晶体实验捕获的一个结构,PDB代码是1M17,好医师网,而实际上那2个尾巴是在蛋白的表面,受热力学影响它们具有一定的灵活性。)
图2:3个针对EGFR治疗肺癌的药物分子。贝达公司把特罗凯的2个尾巴接上,干掉2个氢原子,也就制造了轰动一时的中国新药研发事件。【4】他们认为这个新药具有优良的药代动力学性质,可能减少副作用。如果真的能够给病人带来福音,那些辛苦耕耘了几十年也没有发明一个新药的化学师傅们就不要过多地说三道四了。
图3:读图。中间是从剑桥小分子晶体数据库里里面搜出来的一个冠醚结构。金属钠离子被2个冠醚分子从上下包抄。有点像是二茂铁。 化学师们看到这种结构要是不心动,怕真是有愧于你们的称呼啊。
图4:Tomtovok, 便是本文开始提及的治疗肺癌的新药【7-8】。
学过有机化学的不能忘记迈克尔加成反应。也只有化学师傅们能够想得出有这么做药的。不过,虽然很多人尝试了类似的策略,即通过和蛋白形成化学键来达到特别的效果,成功的例子还是非常少,因为CYS(CYSTINE,胱氨酸)这个氨基酸普遍存在于各类蛋白,利用这种机理做成的药物就可能会给病人带来较大的毒副作用。当然,上面的新药是针对癌症患者,它的安全性标准就不同了。
【博文预报:《美女爱上化学键》,不过,这种文章不敢随便发表,就是写好了也只有藏起来自己没事就偷着乐了:-)】
参考
【1】FDA是地球上真正负责为民做事的政府机构之一,为百姓提供各种服务,包括可以免费向任何人发布电子邮件,通知你关心的食品和药品新闻,比如新一代伟哥获批了,某个心脏起搏器被发现马达有问题,等等。 具体参考FDA网页
【2】 在分子生物学或者生物化学里头,碰到“因子”(factor)这个词,很可能说的就是某个蛋白质。至少对很多恶心生物名称的化学师傅们来说,这种策略比查字典会更加管用。
【3】
【4】 ?m=20090929150653296018
【5】
【6】
【7】
【8】
FDA的网页指出这个药针对的是晚期非小细胞肺癌患者,而且患者的EGFR基因具有特别的突变 (EGFR exon 19 deletions or exon 21 L858R substitution mutations)。这类病人大约占10%左右。同时,FDA也批准了相关的基因突变诊断方法。
【9】 化学师,几天前在我的BMS和铊盐的博文里面注解过,因为它很不常见,所以这里引用一下。化学师,应该是英文 chemist 的翻译。很多时候chemist 也被翻译成化学家。在英文里面,chemist 指代的仅仅是以化学为专业毕业或者为主要职业的人,比如刚刚大学毕业的实验员,而很多功成名就的化学大家,在介绍自己时,也可能说自己是个 chemist,基本上就是说,化学是我的本行,或者说,别的东东,要是我搞错了,那就不是我的原罪了 :-)
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